于是，基列‧耶琳城的人把上主的约柜接来，抬到一座小山上，放在亚比拿达的家里。他们特别委派亚比拿达的儿子以利亚撒看守约柜。

上主的约柜留在基列‧耶琳城很久，大概有二十年。在这段时期，以色列人都向上主求助。

撒母耳对以色列人民说：“如果你们专心归向上主，就必须弃绝所有外族的神明和亚斯她录女神的神像。你们要把自己完全献给上主，只事奉他。这样，他就会救你们脱离非利士人的辖制。”

于是以色列人除去巴力和亚斯她录偶像，只事奉上主。

撒母耳召集所有以色列人到米斯巴，对他们说：“我要在那里为你们向上主祷告。”

于是他们都聚集到米斯巴。他们打水来浇在上主面前，当作祭物，并且禁食一整天。他们说：“我们得罪了上主。”（米斯巴是撒母耳替以色列人处理纠纷的地方。）

非利士人听到以色列人聚集在米斯巴，那五个非利士首领就带领军队出来攻击他们。以色列人听见这消息很害怕，

就对撒母耳说：“请继续为我们向上主—我们的上帝祷告，求他救我们脱离非利士人。”

撒母耳宰了一只小羊作全牲的烧化祭献给上主。他祈求上主帮助以色列；上主应允了他的祷告。

撒母耳在献烧化祭的时候，非利士人前来攻击。正在这时候，上主从天上雷击他们，使他们溃乱逃退。

以色列人从米斯巴出来，一直追击敌人到伯‧甲附近，沿路击杀他们。

后来，撒母耳在米斯巴和善之间立了一块石头，说：“上主一直帮助了我们”，于是叫这石头做“以便以谢”，意思是“帮助之石”。

这样，非利士人被打败了。撒母耳有生之日，上主没有让非利士人再侵犯以色列领土。

从以革伦到迦特，所有被非利士人夺去的城镇都归还了以色列。以色列收复了全部领土。那时，以色列人跟迦南人和平相处。

撒母耳一生作士师领导以色列。

他每年要出去巡视伯特利、吉甲，和米斯巴，在这些地方处理纠纷。

出巡以后，他都回到家乡拉玛，在那里作士师。他在拉玛为上主筑了一座祭坛。